遗传疾病诊断速度大幅提升

科技日报北京7月28日电孟德尔遗传病患者通常
要经过6年以上测试才能得到诊断结果。但现在,沙
特阿卜杜拉国王科技大学研究人员开发出一种准确而
快速的方法,名为NanoRanger,可在几个小时内对
这一类疾病进行基因检测,从而改变传统遗传疾病诊
断。研究成果发表在新一期《Med》杂志上。

孟德尔遗传病包括运动系统、神经系统和智力
发育障碍,是由某个特定基因的改变或基因组中某个
片段的异常重排引起的。每种疾病都有一个特定的“断
点”——结构变异的基因组位置,DNA在该位置被删
除、重排或倒置。虽然这些变异可以通过传统的筛查
技术来识别,但重排的复杂性意味着它们经常被遗漏

NanoRanger使用简单的分子生物学策略,找出
了那些疑似存在复杂突变、缺失或重排的基因组区域
。该技术成本效益高,只需要患者或疑似携带者的少
量DNA。NanoRanger采集基因组DNA样本,使用称
为限制性酶的分子剪刀将DNA切成具有相同末端序列
的片段。然后这些片段自我连接成环并进行扩增,再
利用长读测序技术,可更容易定位和测序受关注的基
因组区域。

使用定制数据分析工具,NanoRanger已可精确
绘制单碱基对分辨率的断点,提供有助于诊断遗传疾
病的详细图像。其在初次测序后12分钟即可作出诊断
。NanoRanger成功确定了13个家族性基因组疾病病
例中的精确断点,而这些断点,正是传统基因测试所
遗漏的。

近几十年来,基因检测技术取得了快速进展,但
这一技术的福利并未惠及孟德尔遗传病患者——全球
超过一半的疑似孟德尔遗传病患者很难得到准确的分
子诊断,因而无法及时获得干预治疗。现在,凭借最
新技术确定的断点,研究人员已经筛查了大量风险家
庭成员和1000名健康个体。已有至少一对参加试验的
夫妇被发现携带一种遗传性孟德尔疾病的基因缺失,
从而果断选择了体外受精,避免了又一个悲剧的发生

(张梦然)

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